לימודי סקיפר הם הכשרה מודרכת שמאפשרת לאנשים לקבל את האמצעים והידע הנדרש כדי להפליג ולהתנהל על כלי שיט. בתהליך הלמידה, המשתתפים לומדים לא רק את הפרטים הטכניים של ההיגוי וההפלגה, אלא גם את כללי הבטיחות וההתנהגות בים, המזוהים עם מקצועות הסקיפר. במהלך הלימודים, הסטודנטים מקבלים הכשרה מעשית בתנאי שדה, שמתווספת לתיאוריה שמסייעת להם להבין את המורכבות של עולם הספנות.
לימודי סקיפר מציעים לתלמידים מגוון של קורסים, שניתן להתאים בהתאם לרמת הניסיון והידע הקודם של כל תלמיד. ישנם קורסים בסיסיים המיועדים למי שמעולם לא הפליג לפני כן, כמו גם קורסים מתקדמים למי שכבר יש לו ניסיון. בנוסף, המוסדות המלמדים את לימודי הסקיפר מציעים הכשרה למגוון סוגי רישיונות, כמו רישוי סקיפר ימי עבור הפלגות תוך